2003년 2월 1일, 그는 만디나를 7라운드에 KO시키고 IBF 페더급 챔피언십 타이틀을 획득했습니다.
2003년 11월 1일에 그는 7라운드에 게이너를 KO시키고 우승했습니다. WBA 페더급 타이틀을 다시 획득했습니다.
2007년 3월 17일 그는 바레라를 승점으로 꺾고 WBC 플라이급 골드 벨트를 획득했습니다.
2008년 9월 14일 11라운드에서 카사마요르를 KO시키고 우승했습니다. WBO 경량 잠정 타이틀
2009년 2월 28일, 10라운드에서 Juan Diaz를 KO로 누르고 WBA/WBO 경량 골드 벨트 2개를 획득했습니다(2009년 최고의 복싱 매치)
2010년 7월 31일 제2차 세계대전에서 후안 디아즈를 승점 차로 꺾었다
2012년 12월 9일 6라운드에서 파퀴아오의 상대를 강타했다
'네 번째 복싱' 파이트'는 미국 카지노 도시 라스베이거스에서 열린 WBO 웰터급 타이틀전에서 파퀴아오와 마르케스가 맞붙었다. 결국 마르케스는 6라운드에서 파퀴아오를 KO시키며 복수에 성공했고, 파퀴아오는 생애 처음으로 KO당했다. 승리 후 마르케스는 두 사람의 머리가 새겨진 특별 WBO 챔피언십 골드 벨트를 받았습니다.
이번 복싱 챔피언십 경기에 앞서 '필리핀 국보'로 알려진 파퀴아오는 멕시코의 영웅 마르케스와 3차례 대결을 벌인 결과, 파퀴아오는 3전 1무 2패를 기록했다. 승리가 유리했지만 양측 모두 상당한 수준의 경기력을 보여줬고, 마르케스의 라이브 실력은 심지어 파퀴아오를 능가하기도 했다.
'제4차 복싱 전쟁' ***은 12라운드 동안 진행되며, 각 라운드는 3분입니다. 1~2라운드까지 양측은 교착상태에 빠졌다. 3라운드가 시작된 지 1분 25초여 만에 마르케스는 무거운 오른손으로 파퀴아오의 얼굴을 강타했지만 파퀴아오는 다시 일어섰다. 몇 초.
4라운드부터 파퀴아오가 가속에 나섰고, 마르케스는 계속 수비에 집중하며 공격력이 부족했다. 경기도 파퀴아오의 리듬에 돌입했다. 5라운드에서는 파퀴아오가 기회를 놓치지 않고 오른쪽 펀치로 마르케스를 넘어뜨렸지만 마르케스는 곧바로 일어나 경기를 이어갔다.
6라운드에서 마르케스는 파퀴아오를 오른손으로 때렸는데, 파퀴아오가 넘어지는 순간 마르케스는 다시 왼손으로 쳐내며 치명적인 공격을 가해 파퀴아오를 KO시켰다. 결국 마르케스는 파퀴아오를 KO로 꺾고 눈길을 끄는 승리를 거뒀다. 마르케스는 경기에서 승리한 후 세계복싱기구(WBO)가 특별히 제작하고 두 남자의 머리가 새겨진 WBO 챔피언십 골드 벨트도 받았습니다.