EVA 극장판: 파괴' 는 일본이 미지의 공격을 당한 후 NERV 특수부대가 전면 반격을 벌이는 이야기를 주로 묘사했다. 줄거리가 시작되면서 일본은 알 수 없는 힘의 공격을 받아 대규모 파괴와 혼란을 초래했다. 총사령관 () 인 원도 () 의 지도하에 NERV 특수부대는 EVA 1 호기를 가동하여 사도들과 격전을 벌였다. 한차례의 고된 전투 끝에 1 호기는 사도들을 성공적으로 물리쳤지만, 운전자인 지진사도 심각한 피해를 입었다.
한편, NERV 과학자 적목율자 박사는 사도들의 생명활동과 밀접한 관련이 있는' LCL' 이라는 신비한 액체를 발견했다. 연구에서 율자 박사는 인간과 사도들이 실제로 * * * 같은 기원을 가지고 있다는 놀라운 비밀을 발견했다. 이 비밀을 밝히기 위해 NERV 는' 인간 완성 계획' 이라는 신비한 실험을 진행하기로 했다. 그러나 이 실험의 결과는 모든 사람의 예상을 뛰어넘어 일련의 예측할 수 없는 사건을 초래했다.
전반적으로' EVA 극장판: 파괴' 는 원작을 바탕으로 더 깊은 줄거리와 캐릭터의 내면묘사를 통해 미지의 도전에 직면했을 때 인류가 보여준 용기, 지혜, 희생정신을 더욱 보여준다. 동시에 영화는 인류 자체의 기원과 존재의 의미를 탐구하여 관객들에게 깊은 사고를 남겼다.