효모는 단세포 곰팡이이며 계통발생 분류의 단위가 아닙니다. 1,000종 이상의 효모가 알려져 있습니다. 포자(자낭포자와 담자포자)를 생성하는 효모의 능력에 따라 효모는 세 가지 범주로 나눌 수 있습니다. 포자 형성 균주는 자낭균과 담자균에 속합니다. 포자를 형성하지 않고 주로 발아를 통해 번식하는 곰팡이를 불완전 곰팡이, 즉 "유사 효모"라고 합니다. 현재 대부분의 효모는 자낭균문(phylum Ascomycota)으로 분류되는 것으로 알려져 있습니다. 효모의 주요 성장 환경은 습하거나 액체 환경이며, 일부 효모는 살아있는 유기체에서도 생존할 수 있습니다.
생리
효모는 의무적 또는 조건적 호기성 생활을 할 수 있습니다. 현재 의무적 혐기성 효모는 없습니다. 산소가 없을 때 발효 효모는 설탕을 이산화탄소와 에탄올로 전환하여 에너지를 얻습니다.
C6H12O6(포도당) →2C2H5OH + 2CO2
양조 과정에서 빵을 굽거나 찐빵을 찌는 과정에서 에탄올이 유지되고, 이산화탄소는 반죽을 상승시킵니다. 알코올 휘발성.
번식
효모는 발아를 통해 무성생식하거나 자낭포자 형성을 통해 유성생식을 할 수 있습니다. 무성생식은 환경조건이 적합할 때 모세포에서 새싹이 자라나 점차 성숙한 크기로 자란 후 모세포에서 분리되는 것을 의미합니다. 영양상태가 좋지 않으면 유성생식을 할 수 있는 일부 효모는 조건이 맞으면 포자를 형성하고 발아하기도 한다. 칸디다와 같은 일부 효모는 무성생식을 할 수 없습니다.
효모 성장 조건:
영양: 효모는 다른 살아있는 유기체와 마찬가지로 유사한 영양분을 필요로 하며, 박테리아와 마찬가지로 일련의 세포 내 및 세포 외 효소 시스템을 갖추고 있으며 거대 분자 물질을 분해하는 데 사용됩니다. 세포 대사에 의해 쉽게 활용되는 작은 분자 물질로 변환됩니다.
물: 박테리아와 마찬가지로 효모도 생존하려면 물이 있어야 하지만 일부 효모는 박테리아보다 물이 덜 필요합니다. 꿀, 잼과 같은 수분은 삼투압에 대한 내성이 상당히 높다는 것을 나타냅니다.
산도: 효모는 pH 3~7.5 범위에서 자랄 수 있으며 최적의 pH 값은 pH4.5~5.0입니다.
온도: 효모 세포는 일반적으로 물의 어는점 이하 또는 47°C 이상의 온도에서는 성장할 수 없습니다. 최적의 성장 온도는 일반적으로 20°C에서 30°C 사이입니다.
산소: 효모는 호기성 환경과 혐기성 환경 모두에서 자랄 수 있습니다. 즉, 효모는 산소가 없으면 설탕을 알코올과 물로 분해합니다. 산소가 있으면 설탕을 이산화탄소와 물로 분해합니다. 산소가 있으면 효모가 더 빨리 자랍니다.
격리
대부분의 효모는 일부 과일(포도, 사과, 복숭아 등)이나 식물 분비물(예: 선인장 주스)과 같이 설탕이 풍부한 환경에서 분리될 수 있습니다. 일부 효모는 곤충 내부에 산다.
용도
가장 흔히 언급되는 효모인 Saccharomyces cerevisiae는 수천 년 전부터 빵과 찐빵의 발효 과정에서 빵과 포도주를 발효시키는 데 사용되어 왔습니다. 반죽에서 이산화탄소가 방출됩니다.
효모는 단순한 단세포 진핵생물로 배양이 쉽고 성장 속도가 빠르기 때문에 현대 생물학 연구에 널리 활용되고 있다. 예를 들어 Saccharomyces cerevisiae는 중요한 모델 유기체이자 유전학 및 분자 생물학의 중요한 연구 재료입니다.
위험
일부 효모는 유기체나 가전제품에 해롭습니다. 예를 들어, 붉은 효모(Rhodotorula)는 샤워 커튼과 같은 촉촉한 가구에서 자랄 수 있습니다. 알비칸스는 질 내벽과 같은 촉촉한 인간 상피 조직에서 자랍니다.
1. 효모 게놈 구성
Saccharomyces cerevisiae 염기서열 분석 프로젝트가 시작되기 전에는 전통적인 유전적 방법을 통해 효모의 RNA 또는 단백질을 암호화하는 약 2,600개의 유전자가 확인되었습니다[4]. Saccharomyces cerevisiae의 전체 게놈 서열을 분석한 결과, 12068kb 전체 게놈 서열에 특정 단백질을 코딩하는 오픈 리딩 프레임이 5885개 있다는 사실이 밝혀졌습니다. 이는 평균적으로 효모 게놈에는 2kb마다 단백질을 코딩하는 유전자가 있다는 것을 의미합니다. 즉, 전체 게놈의 뉴클레오티드 서열의 72%가 오픈 리딩 프레임으로 구성되어 있다는 의미입니다[5].
이는 효모 유전자가 다른 고등 진핵생물의 유전자보다 더 밀접하게 배열되어 있음을 보여줍니다. 예를 들어, 선충 게놈에서는 평균 6kb마다 단백질 코딩 유전자가 있고[6], 인간 게놈에서는 평균 30kb 이상의 염기마다 단백질 코딩 유전자가 발견됩니다. 효모 게놈의 소형화는 유전자간 영역이 짧고 유전자의 인트론이 희박하기 때문입니다. 효모 게놈의 오픈 리딩 프레임의 평균 길이는 1450bp 또는 483 코돈입니다. 가장 긴 것은 염색체 XII에 위치한 알려지지 않은 기능의 오픈 리딩 프레임(4910 코돈)입니다. 1500개의 코돈. 효모 게놈에는 짧은 단백질을 암호화하는 유전자, 예를 들어 40개의 아미노산으로 구성된 세포질 막 단백질 지질을 암호화하는 PMP1 유전자도 있습니다. 또한, 효모 게놈에는 염색체 XII의 긴 끝에 배열된 약 140개의 RNA 암호화 유전자, 16개 염색체에 흩어져 있는 SnRNA를 암호화하는 40개의 유전자, 43개 계열에 속하는 275개의 tRNA 유전자도 게놈에 널리 분포되어 있습니다. 표 1은 각 염색체의 효모 유전자 분포에 대한 개요를 제공합니다.
표 1 효모 염색체 개요
염색체 수
길이(bp) 유전자 수 tRNA 유전자 수
I 23× 103 89 4
II 807188 410 13
III 315×103 182 10
IV 1531974 796 27
V 569202 271 13
VI 270×103 129 10
VII 1090936 572 33
VIII 561×103 269 11
IX 439886 221 10
X 745442 379 24
XI 666448 331 16
XII 1078171 534 22
/p>
XV 1092283 560 20
XVI 948061 487 17
시퀀싱을 통해 효모 게놈의 광범위한 기본 구성 변화가 밝혀졌습니다. 대부분의 효모 염색체는 GC가 풍부한 DNA 서열과 GC가 부족한 DNA 서열의 다양한 정도와 광범위한 모자이크로 구성됩니다[5, 7]. GC 함량의 이러한 변화는 염색체의 구조, 유전자의 밀도 및 재조합 빈도와 관련이 있습니다. GC 함량이 높은 영역은 일반적으로 염색체 팔의 중앙에 위치하며 이 영역의 유전자 밀도는 높습니다. GC 함량이 낮은 영역은 일반적으로 텔로미어 및 동원체에 가깝고 이 영역의 유전자 수가 상대적으로 적습니다. 5, 8]. Simchen 등은 효모에서 유전적 재조합의 상대적 발생률, 즉 이중 가닥 파손의 상대적 발생률이 염색체의 GC가 풍부한 영역과 결합되어 있으며 서로 다른 염색체의 재조합 빈도가 다르다는 것을 확인했습니다. . 더 작은 염색체 I, III, IV 및 IX의 재조합 빈도는 전체 게놈의 평균 재조합 빈도보다 높습니다.
효모 게놈의 또 다른 명백한 특징은 많은 DNA 반복 서열을 포함하고 있으며 그 중 일부는 rDNA 및 CUP1 유전자, Ty 인자 및 파생된 단일 LTR 서열과 같이 정확히 동일한 DNA 서열입니다. 등 [8] . 오픈 리딩 프레임 또는 유전자의 스페이서 영역에는 많은 수의 트리뉴클레오티드 반복이 포함되어 있어 큰 관심을 끌었습니다. 일부 인간 유전병은 트리뉴클레오티드 반복 수의 변화로 인해 발생하기 때문입니다. 서로 상동성이 높은 DNA 서열이 더 많으며, 이러한 DNA 서열을 유전적 중복성(genetic redundancy)이라고 합니다[8, 10]. 여러 효모 염색체의 말단에는 수십 kb 이상의 길이를 갖는 상동성이 높은 영역이 있으며, 이는 유전적 풍부함의 주요 영역입니다. 유전적 과잉의 또 다른 형태는 단일 유전자 복제인데, 그 중 분산형이 가장 일반적이고 덜 일반적인 유형은 클러스터된 유전자군입니다.
CHR(Clustered Homology Region)은 효모 게놈 서열 분석을 통해 밝혀진 여러 염색체에 위치한 큰 상동성 세그먼트입니다. 각 세그먼트에는 서로 대응하는 여러 개의 상동성 유전자가 포함되어 있으며 배열 순서와 전사 방향이 매우 유사하며 작을 수도 있습니다. 삽입 또는 삭제. 이러한 특징은 군집화된 상동성 영역이 큰 염색체 분절의 복제와 완전한 분화 사이의 중간 산물임을 나타내며, 이는 게놈 진화를 연구하는 데 좋은 재료이며 유전자 복제의 화석이라고 불립니다[5, 8]. 염색체 말단 중복, 단일 유전자 중복 및 클러스터된 상동 영역은 효모 게놈의 유전적 풍부함의 일반적인 구조를 구성합니다. 연구에 따르면 유전적으로 풍부한 유전자 그룹은 동일하거나 유사한 생리학적 기능을 갖는 경우가 많으므로 그중 하나 또는 몇 가지 유전자의 돌연변이는 식별 가능한 표현형을 나타내지 않으며 이는 불리한 효모 유전자에 대한 기능적 연구에 매우 중요합니다. . 따라서 많은 효모 유전학자들은 유전적 풍부함의 본질과 기능적 중요성을 명확히 하고 이와 관련된 실험 방법을 개발하는 것이 효모 게놈에 있는 모든 유전자의 기능을 밝히는 데 있어 주요 어려움이자 핵심 문제라고 믿고 있습니다.
2. 효모 게놈 분석
효모 게놈 서열 분석 이전에는 효모와 포유류에서 다수의 유전자가 유사한 단백질을 코딩하는 것으로 알려져 있었습니다[11]. 일부 상동 유전자에 리보솜 및 세포골격과 같은 구조 단백질을 암호화하는 유전자가 포함된다는 것은 놀라운 일이 아닙니다. 그러나 일부 상동 유전자는 예상치 못한 것입니다. 예를 들어, 효모에서 발견되는 두 상동 유전자 RAS1 및 RAS2는 포유류 H-ras 원암유전자와 매우 상동성이 있습니다. RAS1과 RAS2 유전자가 모두 결여된 효모 세포는 치명적인 표현형을 나타냅니다. 1985년에 RAS1 및 RAS2 유전자에 이중 결핍이 있는 효모 균주가 처음으로 기능 보존을 테스트하는 데 사용되었습니다. 그 결과 포유류 H-ras 유전자가 RAS1 및 RAS2 유전자에 이중 결핍이 있는 효모 균주에서 발현되었을 때 효모 균주가 성장을 회복하십시오. 따라서 효모 RAS1 및 RAS2 유전자는 인간 H-ras 원암유전자와 뉴클레오티드 서열이 매우 유사할 뿐만 아니라 생물학적 기능에서도 보존되어 있습니다.
전체 효모 게놈 서열 분석 프로젝트가 완료되면 얼마나 많은 효모 유전자가 포유류 유전자와 유의미한 상동성을 갖는지 추정할 수 있습니다. Botstein 등은 GenBank 데이터베이스의 포유류 유전자(EST 서열 제외)와 모든 효모 유전자를 비교한 결과 단백질을 암호화하는 효모 유전자 또는 오픈 리딩 프레임의 거의 31%가 포유류 단백질 암호화 유전자와 매우 유사하다는 사실을 발견했습니다. 데이터베이스에는 포유류 단백질을 암호화하는 모든 서열이 포함되어 있지 않거나 심지어 한 단백질 계열의 모든 구성원도 포함되어 있지 않기 때문에 위의 결과는 의심할 여지 없이 과소평가될 것입니다. 효모와 포유류 유전자 사이의 상동성은 전체 단백질이 아닌 개별 도메인으로 제한되는 경우가 많으며, 이는 단백질 진화 과정에서 기능적 도메인의 재배열을 반영합니다. 효모에 있는 5,800개 이상의 단백질 코딩 유전자 중 약 41%(~2,611개)가 전통적인 유전적 방법을 통해 발견되었으며 나머지는 DNA 서열 결정을 통해 발견되었습니다. 효모 유전자에 의해 암호화된 단백질의 약 20%는 다른 유기체에서 알려진 기능을 가진 유전자 산물과 다양한 정도의 상동성을 갖고 있습니다(그 중 약 6%는 강한 상동성을 나타내고 약 12%는 약간 약한 상동성을 나타냄). 기능은 사전에 추측될 수 있습니다. 효모 게놈에 있는 유전자 중 10%(약 653개)는 다른 유기체에서 기능이 알려지지 않은 단백질 유전자와 상동성을 가지며, 이를 고아 쌍 또는 패밀리라고 합니다. 약 25%의 유전자(~1544개)는 발견된 모든 것과 상동성이 없습니다. 단백질 유전자는 처음으로 발견된 새로운 유전자로서 진정한 고아 유전자이다[5, 13]. 이러한 고아 유전자의 발견은 효모 게놈 프로젝트의 중요한 수확입니다. 이들의 기능에 대한 해명은 효모의 생명 과정에 대한 이해를 크게 발전시켜 많은 유전학자들의 관심을 끌 것입니다.
효모 게놈 서열 분석으로 발견된 3,000개 이상의 새로운 유전자의 기능을 체계적으로 분석하기 위해 유럽은 1996년 1월 DNA 서열 분석 작업을 완료하면서 EUROFAN(European Functional Analysis Network)이라는 네트워크를 구축했습니다. . 연구 네트워크.
이 네트워크는 유럽 14개국의 144개 실험실로 구성되어 있으며 서비스 컨소시엄(A1-A4), 연구 컨소시엄(B0-B9) 및 특정 기능 분석 부서(특정 기능 분석 노드, N1-N14) 세 부분으로 구성되어 있으며 각 부분에는 많은 부분이 있습니다. 작은 가지. 이 중 연구팀의 B0 부서는 특정 효모 유전자 결실 돌연변이체를 생산하는 업무를 담당하고 있다. 결실 변이주를 새로 개발된 PCR 매개 유전자 대체 방법을 이용하여 생산하였는데, 즉 박테리아로부터의 카나마이신 저항성 유전자(KanMX)와 선형 곰팡이인 Ashbya gossypil의 프로모터와 종결 서열을 발현 단위로 구축하여 부여하였다. 효모 세포에서 G418에 대한 저항성. 그런 다음 교체할 염색체 DNA 서열에 따라 PCR 프라이머를 설계하고, 이들 프라이머의 외부는 염색체 DNA 서열과 상동성을 가지며, 내부는 PCR에 의해 KanMX 유전자가 증폭될 수 있도록 보장합니다. 유전자 교체 작업 [14]. 이 기술을 통해 새로 발견된 유전자를 의도적으로 KanMX로 대체하여 유전자 결실 돌연변이를 일으킬 수 있으며, 이후 이러한 효모 결실 돌연변이의 표현형을 체계적으로 연구(생존율, 성장률, 접합 능력 등)할 수 있습니다. 이 유전자들 [15]. 이 방법에는 실험 과정을 제한하는 두 가지 문제가 있습니다. 첫째, 대부분의 돌연변이(60% ~ 80%)는 위에서 언급한 유전적 풍부함과 관련된 명백한 돌연변이 표현형을 나타내지 않습니다. 둘째, 많은 돌연변이가 표현형을 가지더라도; 예를 들어 일부 돌연변이는 고온이나 고염 환경에서 성장할 수 없지만 이러한 표현형은 누락된 단백질에 대한 생리적 기능에 대한 정보를 나타내지 않습니다.
3． 모델 유기체로서 효모의 역할
고등 진핵생물, 특히 인간 게놈 연구를 위한 모델 유기체로서 효모의 가장 직접적인 역할은 생물정보학 분야에 반영됩니다. 사람들이 기능이 알려지지 않은 새로운 인간 유전자를 발견하면, 어떤 효모 게놈 데이터베이스에서든 그와 상동성인 알려진 기능을 가진 효모 유전자를 신속하게 검색하고 그 기능에 대한 관련 정보를 얻을 수 있어 인간 유전자의 발달을 가속화할 수 있습니다. 유전자 연구. 연구에 따르면 유전 질환과 관련된 많은 유전자가 효모 유전자와 높은 상동성을 갖고 있는 것으로 나타났습니다. 이러한 유전자에 의해 암호화된 단백질의 생리적 기능과 다른 단백질과의 상호 작용을 연구하면 이러한 유전 질환에 대한 이해를 심화하는 데 도움이 됩니다. 또한, 초기 단계의 당뇨병, 소장암, 심장병 등 많은 중요한 인간 질병은 다유전자 유전 질환입니다. 이러한 질병과 관련된 모든 관련 유전자를 밝혀내는 것은 어렵고 오랜 과정입니다. 질병 관련 유전자 간의 유사성은 진단 및 치료를 개선하는 데 중요한 도움을 제공할 것입니다.
모델 유기체로서 효모의 가장 좋은 예는 연관 분석, 위치 클로닝 및 서열 검증을 통해 얻은 인간 유전 질환 관련 유전자에 대한 연구에 반영됩니다. 후자의 뉴클레오티드 서열은 그것과 일치합니다. 효모 유전자의 상동성은 그 기능 연구에 대한 훌륭한 단서를 제공합니다. 예를 들어, 인간 유전성 비용종증 소장암과 관련된 유전자와 효모의 MLH1, MSH2 유전자, 모세혈관확장증과 관련된 유전자, 효모의 TEL1 유전자, 블룸증후군과 관련된 유전자, 효모의 SGS1 유전자가 모두 있다. 높은 수준의 상동성(표 2 참조). 유전성 비용종증 소장암 유전자는 종양 세포에서 불안정한 짧은 뉴클레오티드 반복 서열의 세포 표현형을 나타냅니다. 인간 유전자가 복제되기 전에 연구자들은 효모 돌연변이(msh2 및 mlh1 돌연변이)에서 동일한 표현형을 가진 유전자를 분리했습니다. 이 결과에 착안하여 소장암 유전자는 MSH2와 MLH1의 상동성 유전자일 것으로 추측되었으며, 이들의 뉴클레오티드 서열 상동성은 이러한 추측을 더욱 확증해 주었다. 블룸증후군은 조숙한 사춘기를 나타내는 유전질환으로, 환자의 세포는 체외배양 시 수명주기가 단축되며, 관련 유전자는 효모의 헬리카제를 코딩하는 유전자와 매우 유사하다. 블룸 증후군 환자의 배양 세포와 유사하게, SGS1 유전자에 돌연변이가 있는 효모 세포는 수명 주기가 상당히 단축된 것으로 나타났습니다[16].
Francoise 등은 기능적 복제를 통해 얻은 170개 이상의 인간 유전자를 연구한 결과 이들 중 42%가 효모 유전자와 명백한 상동성을 갖고 있음을 발견했습니다. 복구와 관련하여 효모 유전자와 뚜렷한 상동성이 없는 인간 유전자는 주로 일부 막 수용체, 혈액 또는 면역 체계 구성 요소 또는 특수 인간 대사 경로의 일부 중요한 효소 및 단백질을 암호화합니다.
표 2 위치적으로 복제된 인간 질병 유전자와 상동성이 높은 Saccharomyces cerevisiae 유전자
인간 질병
인간 유전자
인간 cDNA
GenBank 접근 번호
Yeast 유전자 Yeast cDNA
GenBank 접근 번호 Yeast 유전자 기능
유전성 비용종증 소장암 MSH2
U03911 MSH2 M84170 DNA 복구 단백질
유전성 비용종증 소장암 MLH1 U07418 MLH1 U07187 DNA 복구 단백질
낭포성 섬유증 CFTR N28668 YCF1 L35237 금속항체 섹스 단백질
Wilson's 질병 WND U11700 CCC2 L36317 구리 수송체
글리세롤 키나제 결핍 GK L13943 GUT1 X69049 글리세롤 키나제
블룸 증후군 BLM U39817 SGS1 U22341 헬리카제
X-연관 부신백질이영양증 ALD Z21876 PAL1 L38491 퍼옥시다제 수송체
***모세혈관확장실조증 ATM U26455 TEL1 U31331 P13 키나제
근위축성 측삭 경화증 SOD1 K00065 SOD1 J03279 과산화물 디스뮤타제
영양성 근위축증 DM L19268 YPK1 M21307 세린/트레오닌 단백질 키나제
루이 증후군 OCRL M88162 YIL002C X47047 IPP-5-포스파타제
신경섬유종증 제1형 NF1 M89914 IRA2 M33779 억제 조절 단백질
포함 고등 진핵생물로부터 더 많은 유전 정보를 획득할수록 사람들은 더 많은 효모 유전자가 고등 진핵 생물 유전자와 상동성을 갖는다는 것을 알게 될 것이며, 따라서 생물정보학 분야에서 효모 게놈의 역할이 더욱 중요해질 것입니다. 이는 결과적으로 효모 게놈에 대한 연구를 촉진할 것입니다. . 효모에 비해 고등 진핵생물은 표현형이 더 풍부하여 효모의 특정 유전자 돌연변이로 인한 명백한 표현형 변화의 부족을 보완합니다. 다음 예는 효모와 인간 게놈 연구 사이의 상호 강화 관계를 보여줍니다. 인간 색소성 건피증은 쉽게 피부암으로 발전하는 상염색체 열성 피부 질환입니다. 이미 1970년에 Cleaver 등은 색소성 건피증과 UV 민감성 효모 돌연변이가 뉴클레오티드 절제 복구 경로(뉴클레오티드 절제 복구, NER)의 부족과 관련이 있음을 보고했습니다. 1985년에 최초의 NER 경로 관련 유전자가 서열 분석되어 효모 RAD3 유전자인 것으로 확인되었습니다[19]. 1987년에 Sung은 효모 Rad3p가 진핵 세포에서 DNA 헬리카제 활성의 결함을 복구할 수 있음을 처음으로 보고했습니다[20]. 1990년에 사람들은 색소성 건피증 관련 유전자 xPD를 복제하여 이것이 효모 NER 경로의 RAD3 유전자와 매우 높은 상동성을 가지고 있음을 발견했습니다[21]. 결과적으로, 모든 인간 NER 유전자는 효모에서 상응하는 상동 유전자를 찾을 수 있다는 것이 발견되었습니다. 1993년에 인간 xPBp와 xPDp가 모두 전사 메커니즘에서 RNA 중합효소 II의 TFIIH 복합체의 기본 구성 요소라는 사실이 발견되면서 획기적인 발전이 이루어졌습니다[22]. 따라서 사람들은 효모의 xPBp와 xPDp의 상동 유전자(RAD3 및 RAD25)도 유사한 기능을 가질 것이라고 추측했으며, 이 단서를 바탕으로 만족스러운 결과가 빠르게 얻어졌고 원래의 추측이 확인되었습니다[23].
모델 유기체로서 효모의 역할은 생물정보학뿐만 아니라 고등 진핵 유기체를 검출할 수 있는 실험 시스템을 제공합니다. 예를 들어, 이종 유전자와 효모 유전자의 기능적 보완을 사용하여 유전자의 기능을 확인할 수 있습니다. Bassett의 불완전한 통계에 따르면 1996년 7월 15일 현재 인간과 효모 사이에 최소 71쌍의 상보적 유전자가 발견되었습니다. 이러한 효모 유전자는 6가지 유형으로 나눌 수 있습니다.
(1) 20개 유전자 생물학적 고분자 합성, 호흡 사슬 에너지 대사, 약물 대사 등 생물학적 대사와 관련되어 있습니다.
(2) 16개 유전자는 전사, 전사 후 처리, 번역 등 유전자 발현 조절과 관련되어 있습니다. 및 번역 후처리 및 단백질 수송 등;
(3) 막 수송 단백질에 대한 1개의 유전자 코드
(4) 7개의 유전자는 DNA 합성 및 복구에 관련됩니다. ;
(5) 7개의 유전자가 신호 전달과 관련되어 있습니다.
(6) 17개의 유전자가 세포 주기와 관련되어 있습니다. 이제 점점 더 많은 인간 유전자가 효모 돌연변이 유전자를 보상할 수 있다는 사실이 밝혀져 인간과 효모 사이의 상보적인 유전자의 수가 과거 통계를 훨씬 초과했습니다.
효모에서 기능적 보완 실험을 수행하는 것은 의심할 여지없이 인간 유전자 기능을 연구하는 지름길입니다. 기능이 알려지지 않은 인간 유전자가 기능이 알려진 효모의 돌연변이 유전자를 보완할 수 있다면 두 유전자가 유사한 기능을 가지고 있음을 시사합니다. 기능이 알려진 일부 인간 유전자의 경우 기능 보완 실험을 수행하는 것도 중요합니다. 예를 들어, 갈락토스혈증과 관련된 세 가지 인간 유전자 GALK2(갈락토키나제), GALT(UDP-갈락토실트랜스퍼라제) 및 GALE(UDP-갈락토스 이소머라제)는 각각 상응하는 GAL1, GAL7, GAL10 유전자 돌연변이를 보상할 수 있습니다. 보완적인 실험이 수행되기 전에는 인간과 효모의 유당 대사 경로가 이미 매우 명확했고 여러 효소의 활성 검출 방법도 매우 완벽했으며 순수한 생성물을 얻었으므로 일련의 생화학적 분석이 가능했습니다. 인간 갈락토스혈증 관련 유전자 3종의 성공적인 클로닝 및 분리로 기능적 보완 실험이 가능해졌으며, 인간 갈락토스혈증 관련 유전자와 효모 유전자의 유전자 수준 보존이 더욱 확인되었습니다. 사람들은 이 성과를 더욱 촉진하여 실제 돌연변이와 유전적 다형성을 구별하고, 효모에서 여러 돌연변이의 결합된 표현형을 시뮬레이션하거나, 유전자 내 또는 유전자 간 억제 돌연변이를 스크리닝하는 등 갈락토오스혈증 검출 및 유전자 치료를 위해 효모 시스템을 사용했습니다. ]. 이러한 방법은 다른 유전 질환 연구에도 적용 가능합니다.
이종 유전자와 효모 유전자의 기능을 이용하면 효모를 다른 유기체의 새로운 유전자에 대한 스크리닝 도구로 만들 수도 있습니다. 특정 효모 유전자 돌연변이를 사용하여 인간 cDNA 발현 라이브러리를 스크리닝하여 보완적인 클론을 얻습니다. 예를 들어 Tagendreich 등은 인간 세포의 유사분열 과정에서 역할을 하는 여러 상동 유전자를 분리하기 위해 효모의 세포 분열 돌연변이(cdc 돌연변이)를 사용했습니다. 이 방법을 사용하여 사람들은 농작물, 가축 및 가금류에서 여러 개의 새로운 유전자를 복제하고 분리했습니다[26]. 모델 유기체로서 효모의 역할을 최대한 활용하기 위해서는 효모 생물정보학을 개발하고 효모 내 이종 유전자의 기능적 보완을 위한 연구 방법을 개선하는 것 외에도 효모의 가장 작은 게놈을 확립하는 것도 실현 가능한 접근 방식입니다. 효모의 최소 게놈은 모든 상당히 중복된 유전자를 실험 조건 하에서 합성 배지에서 효모가 성장할 수 있는 최소 수로 감소시키는 것을 의미합니다[10, 27]. 효모에서 알려진 기능의 결함이 있는 유전자를 가진 인간 cDNA 클론의 유전적 보완은 새로운 인간 유전자의 기능을 결정할 수 있지만, 이 보완 실험은 효모 게놈의 다른 중복 유전자에 의해 영향을 받을 것입니다. 구성된 효모 최소 게놈에 보유된 유전자가 인간 또는 바이러스 DNA 서열로 완전히 대체될 수 있다면 대체 표현형은 완전히 외래 유전자에 의존하게 되며 이는 항암 및 항바이러스 약물 시스템을 스크리닝하기 위한 분석이 될 것입니다. . ?
4. 발효 공학에서 효모의 응용
단세포 진핵 효모는 비교적 완전한 유전자 발현 조절 메커니즘과 발현 산물을 처리하고 변형하는 능력을 가지고 있습니다. Saccharomyces.Cerevisiae는 분자 유전학에서 처음으로 인식되었으며 외래 유전자 발현을 위한 최초의 효모 숙주이기도 했습니다.
1981년 Saccharomyces cerevisiae는 최초의 외래 유전자인 인터페론 유전자를 발현했으며 이후 일련의 외래 유전자가 이 시스템에서 발현되었습니다. 비록 인터페론과 인슐린이 Saccharomyces cerevisiae에 의해 대량 생산되어 널리 사용되고 있지만 실험실 결과는 다음과 같습니다. Saccharomyces cerevisiae를 준비할 때 고무적이었지만 실험실에서 산업 규모로 규모를 확장하면 수율이 급격히 감소했습니다. 그 이유는 배양액 내 유리체 플라스미드의 높은 카피수의 선택압이 사라지고 플라스미드가 불안정해지며 카피수가 감소하기 때문이다. 카피 수는 효율적인 발현을 위한 필수 요소이므로 카피 수의 감소는 외인성 유전자의 발현 감소로 직접 이어집니다. 동시에, 실험실 배양 배지의 구성은 복잡하고 비용이 많이 들기 때문에 산업 규모에서 허용되는 배양 배지를 사용할 경우 수율이 감소합니다. Saccharomyces cerevisiae의 한계를 극복하기 위해 1983년 미국의 Wegner 등이 메틸영양성 효모로 대표되는 2세대 효모 발현 시스템을 최초로 개발했습니다. 메틸영양성 효모에는 피치아(Pichia), 칸디다(Candida) 등이 포함됩니다. 피키아 파스토리스를 숙주로 하는 외래 유전자 발현 시스템은 최근 몇 년간 가장 빠르게 발전하여 가장 널리 사용되고 있다. 피키아 파스토리스 시스템이 널리 사용되는 이유는 이 시스템이 일반 효모의 특성에 더해 다음과 같은 장점도 갖고 있기 때문이다.
⑴ 현재 가장 중요한 알코올 산화효소 AOX1 유전자 프로모터를 갖고 있다. 가장 진보된 Strong은 가장 엄격한 규제 메커니즘을 갖춘 프로모터 중 하나입니다.
⑵ 발현 플라스미드는 게놈의 특정 부위에 단일 또는 다중 복사본 형태로 안정적으로 통합될 수 있습니다.
⑶ 이 균주는 고밀도 발효가 용이하고 외래 단백질의 발현이 높다.
⑷ 피치아 파스토리스에는 퍼록시좀이 있는데, 발현된 단백질이 여기에 저장되어 프로테아제에 의한 분해를 피하고 세포에 대한 독성을 줄일 수 있습니다. 거의 10년의 개발 끝에 Pichia.pastoris 유전자 발현 시스템은 기본적으로 비교적 완전한 외래 유전자 발현 시스템이 되었습니다. 고밀도로 발효가 용이하고, 발현된 유전자가 숙주 게놈에 안정적으로 통합되어 제품을 생산할 수 있습니다. 효과적으로 분비되고 적절하게 글리코실화됩니다. 편리성과 경제성과 같은 특징을 개발합니다. 강력하고 제어 가능한 프로모터 AOX1을 사용하여 HBsAg, TNF, EGF, 파상풍 독소 C 단편 및 유전자 조작 항체와 같은 다양한 외래 유전자가 효율적으로 발현되었으며, 이는 이 시스템이 효율적이고 실용적이며 발현 및 증가가 간단하다는 것을 확인시켜 줍니다. 제품의 생물학적 활성을 유지하는 특성이 뛰어난 외인성 유전자 발현 시스템으로, 산업 규모로의 확장에 매우 적합합니다.
현재 미국 FDA는 이 시스템에서 파생된 유전공학 제품을 평가할 수 있다. 최근 이 시스템에서 파생된 세펠론 제제가 FDA의 승인을 받았기 때문에 이 시스템은 안전한 것으로 간주된다. Pichia.pastoris 발현 시스템은 생명공학 분야에서 점점 더 중요한 역할을 담당하여 이 시스템에서 더 많은 외래 유전자의 효율적인 발현을 촉진하고 광범위한 유전공학 제품을 제공할 것입니다.
효모는 호흡을 통해 이산화탄소를 발생시킵니다!