Aspergillus flavus M1을 검출하는 방법은 일반적으로 면역친화성 크로마토그래피, 고성능 액체 크로마토그래피, 효소결합 면역흡착 분석(키트) 등이 있습니다. 전자의 방법은 고성능 액상을 주로 사용하고, 후자의 방법은 마이크로플레이트 리더를 사용한다. 고성능 액체 크로마토그래피는 비용이 많이 들고 테스트하기 번거롭기 때문에 오늘날 시장에서 Aspergillus aflatoxic M1을 검출하는 데 후자 방법이 주로 사용됩니다.
또한 면역친화성 크로마토그래피 정제형광광도측정법도 있는데, HPLC법과 달리 면역친화성 컬럼으로 시료를 정제한 후 형광분광광도계를 이용해 직접 형광강도를 측정한다. 강도 값은 아플라톡신 M1의 농도에 비례합니다. 이 방법도 HPLC 방법에 비해 조작이 간편하고 안전하지만 여전히 비용이 많이 드는 문제가 있습니다.