아마 매트릭스 온라인의 가장 흥미로운 측면은 적어도 이론적으로는 플레이어의 행동을 기반으로 전개되는 줄거리일 것입니다. 그러나 줄거리가 설명되는 대부분의 방식은 간단한 텍스트 정보를 통해서입니다. 이 게임에는 세력 지도자와의 만남과 같은 중요한 순간에만 약간의 음성 연기가 있습니다. 대사가 형편없고 가끔 오타가 나기도 합니다. 하지만 이 게임에는 장점도 있습니다. 세 세력의 개성이 모두 뛰어나다는 것입니다. 기계와 함께 살아남으려는 인간, 신세계에서 자신의 권위를 유지하려는 기계, 그리고 신비한 지하 조직인 "The Exiles"도 포함됩니다. 분명히 인간은 이 전투에서 "좋은 사람"이지만 다른 두 세력은 절대적으로 "나쁜 사람"이 아니며 플레이어가 인간으로서 다른 두 세력에 합류하는 것도 흥미로울 것입니다. 그러나 실제로는 다른 세력에 합류하기로 한 선택이 게임에 큰 영향을 미치지 않습니다. 완료해야 하는 작업은 모두 동일하며, 유일한 차이점은 해당 작업을 완료하는 사람입니다.
게임의 상당히 개방적인 캐릭터 개발 시스템을 통해 마스터하고 싶은 기술을 자유롭게 선택할 수 있습니다.
게임의 핵심은 여타 온라인 RPG 게임과 크게 다르지 않습니다. 이 게임에서 "해커"와 "오퍼레이터"는 다른 유사한 게임의 마술사 및 전사의 역할과 동일합니다. 따라서 다른 온라인 RPG 게임을 플레이한 적이 있다면 이 게임을 빠르게 시작할 수 있습니다. 게임의 전투는 반턴 기반이며 임무는 무작위로 생성됩니다. 적을 물리치고 임무를 완수하면 돈, 경험치, 총기, 옷 등 전리품을 얻을 수 있습니다. 혼자서 임무를 완료할 수도 있고, 다른 플레이어들과 팀을 이루어 임무를 완료할 수도 있습니다. 또한 최대 12명의 플레이어가 '크루'(영화 속 우주선 승무원처럼)라는 보다 안정적인 팀을 구성할 수 있습니다. 여러 "승무원" 팀이 "진영"을 형성할 수도 있는데, 이는 다른 유사한 게임의 길드와 동일합니다. 전투 측면에서는 백병전, 총격전, '바이러스'(즉, 마법) 외에도 플레이어는 '컴파일'을 통해 일부 소품을 만들 수도 있습니다. 간단히 말해서, Matrix Online에는 다른 온라인 RPG에서 찾을 수 있는 모든 것이 있지만 대부분은 다른 이름으로 되어 있습니다. 또한, 게임 인터페이스가 그다지 사용자 친화적이지는 않지만 내장된 미디어 플레이어와 AOL 인스턴트 메시징과 같은 일부 기능은 여전히 매우 유용합니다.