규모와 사업 범위에 차이가 있다.
1. 규모: 남대문시장은 국내 최대 규모의 종합 전통시장으로 생필품을 판매하는 대규모 전통시장인 반면, 동대문시장은 국내 최대 규모의 도소매 시장이자 아시아 최대 규모이다. 도매시장 중 하나.
2. 사업범위: 남대문시장은 주로 아동복, 남성의류, 여성의류 등 일상생활에 필요한 대형 전통시장을 판매하고 있으며, 동대문시장은 국내 최대 규모의 의류도매시장이다. 한국에서는 주로 여성 의류를 판매하지만 일부 액세서리 및 기타 제품도 판매합니다.