다음 날 밤, 거대한 문어가 마을을 공격하고 괴물이 등장합니다! 고릴라 킹콩은 마을 벽을 허물고 문어를 내쫓습니다. 킹콩은 마을에 저장된 다량의 체세포 플라즈마 주스에 매료됩니다. 여러 통의 주스를 마신 후 그는 혼수상태에 빠집니다. 일본인들은 킹콩이 제약 회사의 슈퍼스타 광고주가 될 가능성을 염두에 두고 뗏목을 만들어 약에 취한 괴물을 일본으로 데려옵니다.
일본 정부는 킹콩을 태운 배를 가로채지만 이미 늦었죠. 마취에서 깨어난 킹콩은 탈출을 위해 몸부림치다가 배는 폭발하고 킹콩은 탈출해 일본으로 헤엄칩니다. 두 괴수 사이의 전쟁은 피할 수 없었죠.
고질라는 홋카이도에 상륙하여 남쪽으로 이동합니다. 닛코시 근처의 숲에서 킹콩을 처음 만납니다. 킹콩은 고질라에게 돌을 던지며 힘을 과시하지만 고질라의 핫와이어가 더 강력해 킹콩은 쓰러지고 맙니다. 동시에 고질라를 죽이기 위한 덫이 설치됩니다. 휘발유를 강에 붓고 불을 붙입니다. 고질라는 강바닥을 직접 건너는 대신 강을 따라 탈출구를 찾지만, 강을 따라가자마자 청산가리가 가득한 커다란 구멍에 빠지고 맙니다. 고질라는 가까스로 살아나지만 고압 송전탑이 길을 막고 도쿄 주변의 이동 범위를 제한합니다. 고질라는 킹콩이 도쿄로 향하는 동안 후지산 주변의 시골을 파괴합니다. 고질라의 길을 막고 있던 송전탑은 킹콩에 의해 쉽게 쓰러집니다. 킹콩이 새로운 영토가 내려다보이는 국회의사당 건물에 올라가는 순간, 하늘에서 딸기 주스 병이 떨어져 킹콩 주변 공중에서 폭발하고 킹콩은 다시 한 번 기절합니다. 킹콩에게 부착된 대형 풍선이 후지산으로 이동합니다. 자위대는 괴물 중 적어도 한 마리라도 파괴할 수 있기를 바랍니다.
킹콩과 고질라는 다시 한 번 후지 고원에서 전투를 벌입니다. 고질라는 의식을 잃은 킹콩을 때리고 열선을 방출해 주변 숲에 불을 지릅니다. 하지만 바로 그때 이 지역에 전기 폭풍이 지나갑니다. 여러 차례 번개를 맞은 킹콩의 몸에 번개 에너지가 전달되고, 킹콩은 번개의 에너지를 흡수한 후 깨어나죠. 킹콩과 고질라가 다시 전투를 벌입니다. 두 사람은 피를 튀기며 싸우고 시골의 항구와 뜨거운 바다로 향해요. 서로 세게 주먹을 날리며 뜨거운 바다는 거의 파괴될 지경에 이릅니다. 마침내 두 괴수는 언덕 아래로 굴러 떨어져 바다에 빠졌어요. 잠시 후 바즈라가 수면 위로 올라와 헤엄쳐서 파로 섬으로 돌아왔어요.
주:이 영화에는 두 가지 결말이 없습니다: 일본판 고질라가 승리하고 미국판 킹콩이 승리합니다.