첫째, 식품 안전 문제를 일으키는 생물학적 오염:
생물성 오염은 유해한 바이러스, 세균, 곰팡이 및 기생충 오염 식품을 가리킨다. 미생물 식품 오염에 속하는 세균, 곰팡이는 인간의 육안으로는 보이지 않는다. 계란은 악취가 나고 채소는 썩는데, 주로 세균과 곰팡이가 작용한다. 세균은 여러 종류가 있는데, 일부 세균은 변형균, 황색균, 장균과 같이 동물성 식품을 직접 오염시킬 수도 있고, 도구, 용기, 세척수 등을 통해 동물성 식품을 오염시켜 식품부패를 변질시킬 수도 있다. 곰팡이의 종류는 매우 많은데, 5 만여 종이 있다. 인간을 위해 봉사한 최초의 곰팡이는 바로 곰팡이의 일종이다. 요즘 사람들이 먹는 썩은 젖과 소스 제품은 곰팡이와 불가분의 관계에 있다. 하지만 그 중 100 여 종의 균주는 독소를 생성하는데, 가장 독성이 강한 것은 아플라톡신이다. 식품은 이 독소에 오염된 후 동물의 원발성 간암을 일으킬 수 있다. 식품 중 아플라톡신이 높은 지역에서는 간암 발병률 수치가 다른 지역보다 수십 배나 높은 것으로 조사됐다. 영국 과학자들은 유방암이 아플라톡신과 관련이 있을 수 있다고 생각한다. 우리나라 화동 중남 지역의 기후는 온습하고 아플라톡신 오염은 비교적 보편적이며, 주로 땅콩 옥수수, 쌀 등의 식품을 오염시킨다. 식품을 오염시키는 기생충은 주로 진딧물, 진딧물, 선충충 등이 있는데, 이 기생충들은 일반적으로 환자, 병든 동물의 배설물을 통해 수원과 토양을 오염시킨 다음 어류, 과일, 채소를 오염시키는데, 사람이 먹으면 기생충병을 일으킬 수 있다.
둘째, 식품 안전 문제를 일으키는 화학 오염:
화학성 오염은 유해하고 유독한 화학물질 오염 식품으로 인해 발생한다. 각종 농약은 식품 화학성 오염을 일으키는 주요 원천이며 납, 카드뮴, 크롬, 수은, 질기화합물 등 유해 물질을 함유한 공업폐수, 배기가스 및 폐기물도 있다. 식용 색소, 방부제, 발색제, 감미료, 고화제, 항산화제 식품첨가제 식품 포장용 플라스틱, 종이, 금속 용기 등. 폐신문이나 오래된 잡지로 식품을 포장하면 이 종이에 들어 있는 폴리염화 비페닐이 음식을 통해 인체에 들어와 병을 일으킬 수 있다. 폴리 염화 비 페닐은 200 종 이상의 염소화 방향족 탄화수소의 총칭으로, 오늘날 세계에서 생산되고 사용되는 이런 물건의 수가 상당히 많다. 강물, 해수, 수생물, 토양, 대기, 야생동식물, 인유, 지방, 심지어 남극의 펭귄, 북극해의 고래에서도 폴리염화 비페닐의 흔적이 발견됐다는 자료가 있다. 식품은 가공 과정에서 식용 색소를 넣으면 밝은 색을 유지할 수 있다. 하지만 일부 합성 색소는 독성이 있다.