수술실은 엄격하게 소독하고, 수술복을 입고, 수술 중에 애완동물 반응을 관찰하고, 위험을 피해야 한다.
애완동물 병원의 수술실은 무균 수술실이다. 통상적인 설비는 수술대, 그림자등, 기계트레이, 마취제, 지혈가루, 지혈침, 초음파 소독제 등이 있다.