해파리 음식은 주로 규조류, 원생 동물, 갑각류, 다모류, 조개 유충, 어새우 조개 알, 작은 갑각류, 선충, 조개 유충 등 40 여 가지가 있다.
보통 작은 해파리는 플랑크톤과 플랑크톤을 먹고, 큰 해파리는 물고기, 크릴새우 등을 먹는다.