우선 토끼는 알레르기 문제가 생기기 쉽다. 토끼의 모피와 배설물에 들어 있는 단백질 등 물질은 알레르기 반응을 일으키기 쉽다. 특히 민감한 체질에 민감하다. 토끼와 접촉하면 재채기, 코막힘, 피부 가려움과 같은 알레르기 증상이 생길 수 있다.
둘째, 토끼의 배설물과 소변이 실내 환경을 오염시킬 수 있다. 집에서 토끼가 배출하는 배설물과 소변에는 일정한 암모니아와 세균이 함유되어 있어 장기간 축적된 후 냄새가 나기 쉬우며 공기의 질에 영향을 주어 실내 냄새와 공기 오염을 일으킬 수 있다.
또한 토끼의 물린 행동은 가구, 전선 등을 손상시킬 수 있다. 토끼의 이가 빨리 자란다. 이를 갈기 위해 주변 물품을 계속 물어뜯으며 가구, 전선 등의 물품이 파괴돼 가정에 불필요한 경제적 손실을 초래할 수 있다.
또한 토끼는 일정한 공간과 운동이 필요하지만 집에서 기르는 조건 하에서는 토끼에게 충분한 공간과 운동 환경을 제공하기가 어렵다. 장시간 활동을 제한하면 토끼의 신체 기능이 떨어질 수 있어 비만, 소화불량 등 건강 문제가 생기기 쉽다.
마지막으로, 토끼를 기르는 데는 일정한 경제 지출과 시간 정력이 필요하다. 토끼의 음식, 식수, 구충제, 수의사 비용도 모두 고려해야 하고, 토끼우리에 정기적으로 청소하고 관리해야 하며, 토끼에게 적절한 사육환경을 제공하면 시간과 정력을 소모할 수 있다.